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算法提供了发现可能对免疫疗法有反应的患者的新方法:世界微速讯

2023-03-11 09:04:46


(资料图片)

科学家们已经开发出一种使用癌症 DNA 来发现可能受益于免疫疗法的癌症患者的新方法。

研究人员开发了一种计算机算法来区分肿瘤用来躲避免疫系统的两种不同策略——其中一种比另一种更擅长躲避免疫疗法的影响。由伦敦癌症研究所和米兰 Human Technopole 的科学家领导的团队发现,该算法可以通过预测免疫疗法是否可能起作用来帮助指导治疗。它还告诉我们更多关于癌症和免疫系统之间的进化军备竞赛,可能支持早期诊断和治疗癌症的努力。

该研究于 3 月 9 日发表在《自然遗传学》杂志上。

躲避免疫系统

身体的免疫系统可以通过检测细胞表面的“分子标记”(称为新抗原)来识别细胞是外来的。

但是癌症可以采用两种不同的策略来躲避免疫系统。一些癌细胞使用“耳机”机制来逃避免疫反应,即使它们的表面有这些新抗原,而另一些癌细胞则“编辑”其表面新抗原的数量以抑制免疫反应。

利用癌症基因组图谱中33 种癌症类型的 10,000 个癌症样本的基因组数据,研究人员开发了一种计算机算法,可以计算出癌细胞使用哪种策略来逃避免疫系统。

通过观察肿瘤中存在的新抗原数量与突变数量的对比,该模型可以区分这两种策略,即免疫逃逸和免疫编辑。

该团队将他们的算法应用于 Hartwig 医学基金会的 308 种癌症,这些癌症已经扩散到身体的其他部位并接受了免疫疗法治疗,包括皮肤癌、肺癌和头颈癌。其中,26% 对免疫疗法反应良好。这些癌症往往是免疫逃逸的肿瘤,因为它们比没有反应的癌症具有更大的新抗原平均过量。

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